| Toleo | 1.5 |
|---|---|
| Mchapishaji | Bioinformatics Solutions |
| Tarehe ya kutolewa | 18 Mei 2010 |
| Tarehe iliyoongezwa | 14 Jul 2010 |
| Mahitaji ya Os | Windows XP/Vista/7 |
| Mahitaji | None |
| Jumla ya vipakuliwa | 1,034 |
| Vipakuzi kwa wiki | 21 |
| Bei | Free |
Maelezo
ZOOM Lite ni ufuatiliaji wa ramani ya data na programu ya taswira ya kizazi kijacho. Watumiaji wa genome za kumbukumbu za kuingiza na faili fupi za kusoma za Illumina/Solexa au nafasi ya rangi ya AB SOLiD inasoma faili katika miundo anuwai, kama vile * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta n.k. inasoma juu ya mlolongo wa kumbukumbu. ZOOM Lite ina kernel ya haraka na sahihi ya ramani kulingana na nadharia mpya ya mbegu nyingi iliyoundwa. Usomaji wote wa mwisho-mmoja na-wa-mwisho wa urefu anuwai kutoka 15bp hadi 240bp unaweza kushughulikiwa. Idadi yoyote ya kutolingana na kuingizwa/kufutwa moja kwa urefu anuwai kati ya usomaji na mkoa unaolengwa kwenye mlolongo wa kumbukumbu huruhusiwa. Matokeo ya kipekee yaliyopangwa au matokeo bora (juu N) kwa kila kusoma yataripotiwa kulingana na makosa machache na urefu wa indel. Alama za ubora zinatumika kuongeza usahihi wa ramani. Kulingana na kernel ya ramani, ZOOM Lite inaruhusu watumiaji kupakia data ya usomaji wa ndani na data ya mlolongo wa rejea, chagua vigezo sahihi, tengeneza data ya kiwango cha juu sambamba kati ya CPU nne, ufuatilia kazi zinazoendesha, uhifadhi matokeo ya ramani, angalia grafu za ramani ya matokeo na matokeo ya ramani ya pato katika ama .BED au *. Fomati za faili za GFF kwa uchunguzi zaidi na habari ya ufuatiliaji wa kivinjari cha UCSC. Matokeo ya ramani yanaweza kutazamwa kwa kiwango chochote unachotaka, kutoka kwa grafu ya kusoma iliyosomwa juu ya kromosomu nzima hadi mpangilio wa kina wa mfuatano kati ya usomaji na mlolongo wa kumbukumbu. Watumiaji huenda kwa urahisi kwenye maeneo ya kupendeza kwa kubofya na buruta au kutembeza. ZOOM Lite ni kutoka kwa programu ya ZOOM Studio.
