RAPTOR

Maelezo

RAPTOR ni programu ya ubunifu iliyoundwa kwa utabiri sahihi wa muundo wa protini. Inachanganya zana za uchambuzi wa hali ya juu katika suluhisho moja la programu iliyojumuishwa na hutoa njia tatu tofauti za utaftaji. Njia ya kipekee ya kutengeneza programu kamili ya RAPTOR ni bora zaidi kwa kupata templeti za muundo wa malengo na homolojia ya mlolongo mdogo na ina uwezo wa kutoa mifano ya hali ya juu. Muunganisho rahisi kutumia na maadili rahisi ya kuelewa E ni bora kwa Kompyuta na wataalam. Zaidi ya yote, onyesho la angavu la pato huwawezesha watumiaji kuelewa matokeo kwa mtazamo tu Kwa kuzingatia mlolongo wa protini inayolengwa, ikiwa kuna protini inayofanana na muundo wa 3D, inaweza kupatikana kwa kutumia zana za utaftaji kama PSI-BLAST, iliyotolewa pia katika RAPTOR. Muundo wa shabaha hujengwa kutoka kwa muundo unaojulikana; Walakini, wakati homolojia ya mlolongo sio muhimu, i.e. chini ya 25%, PSI-BLAST haiwezi kupata hit nzuri. Tofauti na PSI-BLAST, ambayo hufanya tu utaftaji wa mlolongo, utando wa protini, utambuzi wa mara, hutumia habari zote za homolojia na muundo. Inatafuta mlolongo wa protini na muundo usiojulikana dhidi ya hifadhidata ya miundo inayojulikana. Kwa kutumia kazi ya bao na kufanya uchambuzi wa utangamano kati ya miundo ya pande tatu na mifuatano ya protini, templeti bora ya kimuundo itatambuliwa ambayo itaunda muundo wa mlolongo. Kama matokeo, uzi wa protini hutoa utabiri bora kuliko uigaji wa homolojia wakati kuna homolojia ya mlolongo wa kando.